Το έμβλημα του Δικέφαλου Αετού χρησιμοποιήθηκε για πρώτη φορά ως αυτοκρατορικό έμβλημα από την οικογένεια των Κομνηνών. Συγκεκριμένα, από τον Ισαάκιο το 1057-59. Η παράδοση κάνει λόγο για το μυθικό «HAGA», με προέλευση από τη Μικρά Ασία και ιδιαίτερα την Παφλαγονία, πατρίδα των Κομνηνών.
Ως αυτοκρατορικό έμβλημα δήλωνε τη δύναμη του αυτοκράτορα, και ειδικά τα δύο κεφάλια τη διττή εξουσία του (κοσμική και θρησκευτική), αλλά η επικρατούσα άποψη είναι πως συμβόλιζε την κυριαρχία της Βυζαντινής αυτοκρατορίας σε ανατολή και δύση.
Όπως ήταν φυσικό, ο Δικέφαλος Αετός επελέγη από τους ιδρυτές της ΑΕΚ το 1924 ως έμβλημα του αθλητικού σωματείου που σκοπό είχε να κρατήσει ζωντανή τη μνήμη της βυζαντινής και μικρασιατικής ιστορίας.